La meditación de Sahaja Yoga se basa en la Realización del Ser, por la cual la energía sutil interior del individuo se despierta, lo que le lleva a un estado conocido como "consciencia sin pensamientos". Esta consciencia sin pensamientos o meditación, se da cuando la mente no está perturbada por los pensamientos, si no que permanece perfectamente consciente.^[1a]

La práctica de la meditación en Sahaja Yoga es muy sencilla y se puede practicar en casa o en la oficina, solos o con otras personas. Shri Mataji destacó que dejar de vivir en sociedad para alcanzar la iluminación espiritual era algo innecesario. La base de la técnica es el despertar de esta energía que existe en cada uno de nosotros, y se centra en la elección individual de aceptarla y ponerla en práctica. Se trata de una experiencia de meditación sin esfuerzo, más que de un ejercicio de mindfulness (atención plena) o de concentración.

Estudios médicos realizados en Australia y la India han demostrado que los mecanismos de curación del cuerpo se activan cuando uno medita en consciencia sin pensamientos, pero no cuando uno está simplemente usando un método de relajación como la respiración profunda o la visualización.

Los métodos de relajación son efectivos para reducir el estrés, sin embargo no han demostrado resultados médicos cuantificables, mientras que la meditación Sahaja Yoga sí lo ha hecho.^[1b]

Una característica única de la meditación Sahaja Yoga es el hecho de que no ofrece una única ruta prescriptiva hacia la espiritualidad. Esto quiere decir que no hay restricciones dietéticas ni obligaciones religiosas. Cada practicante tiene la opción de seleccionar su propio camino, su ritmo de progreso y sus metas espirituales. Ningún individuo se ve obligado a seguir ningún camino, no hay un punto de entrada prescrito y cada ruta individual es completamente flexible, un proceso viviente adaptable a las necesidades o circunstancias específicas.^[2]